Zanetti memulai karirnya di klub Vicenza. Dia dijual ke Empoli dalam kesepakatan kepemilikan bersama pada tahun 2003.

Dalam musim pertamanya dengan Empoli, dia hanya membuat 13 penampilan di Serie A. Namun, Empoli diturunkan ke Serie B di akhir musim dan Zanetti tetap mengikuti klub tersebut.

Zanetti memainkan 30 pertandingan di musim 2004-05 Serie B, membantu klub untuk kembali masuk ke Serie A. Namun, dia hanya membuat sembilan kali penampilan untuk klub di Serie A di musim berikutnya.

Pada bulan Mei 2007, Zanetti mengatakan bahwa dia akan tetap di Ascoli, meski terdegradasi ke Serie B. Namun kemudian dia hijrah ke Torino hingga 2011. Pada 19 Januari 2010 dia menjadi pemain pinjaman Atalanta sampai kontraknya di Torino berakhir. Pada bulan Januari 2012 dia bergabung dengan Sorrento Calcio.

Di pertengahan musim tersebut, Torino membeli hak bermain penuh Zanetti. Pada musim 2009/2010, insiden yang disebabkan oleh suporter fanatik Torino menyebabkan Zanetti bersama sejumlah pemain lain untuk berhenti dari aktivitas klub sementara.

Januari 2010, merupakan awal baru bagi pemain ini setelah Atalanta memberikan kontrak pinjaman kepada pemain ini hingga akhir musim. Pada musim berikutnya, Zanetti bergabung dengan Grosetto FC. Januari 2012, Sorrento Calcio, klub divisi bawah Italia, membeli secara penuh hak atas pemain yang dikenal memiliki gaya permainan bertahan ini.

Riset dan Analisis: Mamor Adi Pradhana